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Scanner Pannoramic 3DHistech


Tarif établissement partenaire: 17.47 €/heure
Tarif établissement public et privé : 82.24 €/heure

Brève description :
Système d’imagerie, un automate entièrement dédié à la production de lames virtuelles de lames histologiques (image fond clair et fluorescence).
Objectifs :
20X NA 0.8 Apo
40X NA 0.95 Apo

Cubes filtres:
Quad band- DAPI ex 367-390 em 414-450
Quad band- FITC ex 461-487 em 500-530
Quad band Alexa 546 ex 544-564 em 564-584
Quad band- CY5 ex 626-644 em 660-799
Mono band Alexa 594 ex 570-590 em 661-690
Mono band Cy7 ex 670-745 em 768-849
Détecteur
Caméra : pco edge back illuminated sCMOS (taille de pixel : 6.5µm)

Acquisition automatique (12 lames)
Caractéristiques des lames:
Longueur 75,0 à 76 mm/ lamelle max 50 mm
Largeur 25.0 à 26.0 mm et 51.0 à 52.02 mm
Epaisseur 0,9 à 1,2 mm
Coins biseautés 45°


Publié dans Imagerie automatisée

SEM volutome zeiss

Tarif établissement partenaire: €/heure Tarif établissement public et privé : €/heure
Brève description :
Gemini 360 Zeiss équipé du volutome (module de coupe sériée automatique in situ, serial block face).
Configuré pour l'imagerie à haute résolution des échantillons biologiques
DSC05080 HDR 2
Mode High Vacuum (HV)
Mode Variable Pressure (VP) jusqu'à 60 Pa
Focal Charge Compensation (FCC) avec le Volutome
Résolution max (x,y) en HV:
- 0,7 nm à 15kV
- 1.2 nm à 1kV
- 0.6 nm en STEM à 30kV
Détecteurs:
- SE2 (Everhart-Thornley): électrons secondaires en chambre, HV
- C2D (à casacde de courant): électrons secondaires en chambre VP
- BSD Volutome: électrons rétrodiffusés rétractable, haute résolution basse tension
- in Lens SE et BSD
- aSTEM4: électron transmis rétractable 4 segments
- Portes-objet
- Carrousel standard 9 stubs
- Porte objet corrélatif CorrMic pour lamelles, compatible avec les microscopes photoniques Zeiss
- STEM 12 grilles standard
- porte échantillon Volutome
Suite logicielle:
SMARTSEM : pilotage du microscope
Zen Core : volutome
Atlas 5: acquisition automatisée 2D (mosaïques, multipositions, multiéchelles)
Atlas array tomography: acquisition automatique de coupes sériées
Volutome Zeiss
volume maximal : 1x1x1 mm
Epaisseur minimale de coupe: 20 nm (=Z résolution max)

Publié dans Microscopie électronique à balayage

Sessions Open-Desk

Vous avez des questions sur l'analyse d'images ? Vous avez besoin d'aide pour un script ou une macro ? Vous envisagez de démarrer un projet d'analyse d'images avec nous ? Alors rejoignez-nous à la prochaine session open-desk. L'accès est gratuit et aucune inscription n'est nécessaire, mais nous vous demandons de bien vouloir nous donner quelques informations qui nous aideront à planifier les sessions.

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L'IGMM est le bâtiment situé à côté du CRBM.

Publié dans Français

SPIM: Lightsheet Z.1


Tarif établissement partenaire: 15.66 €/heure
Tarif établissement public et privé : 55.41 €/heure
Technologies associées :
  • Imagerie 3D
  • Vidéomicroscopie
  • Imagerie in vivo

    • Brève description :
    Microscope à feuille de lumière Lightsheet Z.1 Zeiss pour imagerie 3D très rapide de petits organismes vivants (type embryon) ou échantillons transparisés. Ce microscope est équipé d'1 bras d'illumination et d'1 bras de détection comprenant un objectif 20X et 2 caméras.

    piloté par Zen
    Objectifs:
    20X /1zeiss eau n=1.45
    20X zeiss clarification
    5X clarification
    Détecteurs:
    Module “PCO.Edge”, sCMOS, 1920 × 1920 pixels

    Sources d'illumination:
    laser 405nm
    laser 488nm
    laser 561nm
    Sélection spectrale:
    4 filtres d'émission montés dans une roue filtre
    DAPI-GFP
    DAPI-Cy3
    GFP-Cy3
    GFP-DRAQ5

    Incubation:
    température entre 10°C et 40°C, possibilité de mettre du C02
    2 chambres d'incubation un pour les échantillons classique (vivants ou fixés )
    un pour les échantillons clarifiés
    Type d'acquisition:
    -imagerie feuille de lumière multi-couleurs, multi-plans en Z, multi-points temps, multi-angles par rotation de l'échantillon jusqu'à 360°
    Support d'échantillons:
    l'échantillon est préparé dans un capillaire en verre soit enrobé dans un gel, soit déposé au fond d'un puit formé dans un gel. Ce capillaire sera déposé dans un insert porte-échantillon.
    Chaque projet nécessite une adaptation ou un développement spécifique concernant la préparation de l'échantillon
    

    Publié dans Feuille de lumière

    Spinning disc Nikon Ti Andor CSU-W1

    
    Tarif établissement partenaire: 15.66 €/heure
    Tarif établissement public et privé : 55.41 €/heure
    Technologies associées :
  • Imagerie 3D
  • Vidéomicroscopie
  • Imagerie in vivo

    • Brève description :
    Confocal spinning disk ANDOR couplé à un microscope inversé Nikon Ti Eclipse

    Idéal pour l'observation d'échantillons vivants sur plaques multipuits et boites de pétri

    Microscope motorisé en XYZ, contrôle de la température et du CO2

    Objectifs :
    - 4x/0.13
    - 10x/0.45
    - 20x/0.75 DIC
    - 40x/1.15 Water
    - 60x/1.4 Oil DIC
    - 100x/1.45 Oil DIC

    Filtres de fluorescence :
    - DAPI ex BP377/50, DM409
    - FITC ex BP482/35, DM506, Em BP536/40
    - Texas Red ex BP562/40, DM593, Em BP624/40
    - Cy5 ex BP628/40, DM660, Em BP692/4

    Lasers :
    - 405
    - 488
    - 561
    - 640

    Filtres QUAD émission de fluo :
    425-470nm - 505-542nm - 578-623nm - 660-750nm
    Tête spinning disk Yokogawa CSU-W1 équipé de deux dichroïques (triple bande 405/488/561 et un quatre bande 405/488/561/640)

    Caméra N&B Zyla 4.2
    champ = 2048x2048, pixel = 6.5µm
    logiciel IQ3

    Microscope motorisé XYZ : 3D stack, timelapse à fréquence variable, multiposition, mosaïque, multichannel (dimensions cumulables pour la réalisation d'expérimentations à façon), maintient du focus
    Température idéale de fonctionnement entre 19 et 26 °C

    Confinement L2
    

    Publié dans Microscopie confocale

    Spinning disk Dragonfly

    
    Tarif établissement partenaire: 17.47 €/heure
    Tarif établissement public et privé : 82.24 €/heure
    Technologies associées :
  • Imagerie 3D
  • Vidéomicroscopie

    • Brève description :
    Microscope Nikon inversé couplé à un spinning disk Dragonfly Andor dédié à l'imagerie confocale 3D d'échantillons vivants. Ce microscope est possède 2 cameras pour une acquisition simultanée en deux couleurs.
    Piloté par le logiciel Fusion.

    Objectifs:

    10X Plan Apo lambda 0.45 NA 4mm DT air
    20X Plan Apo lambda 0.75 NA 1mm DT huile
    40X Plan Fluor 1.3 NA DT 0.2mm huile
    40X Apo 1.15 NA DT 0.6mm eau
    60X Plan Apo lambda 1.4 NA DT 0.13mm huile
    100X Plan Apo lambda 1.45 NA DT 0.13mm huile

    Détecteur:
    2 caméras EMCCD iXon888 Life Andor
    (1024*1024 pixels, 13µm pixel, position de lentille 2x)
    Contrôle environnemental: température et CO2.
    Type d'acquisition:
    acquisition multi-dimensionnelle en lumière transmise, DIC et confocale en fluorescence: XYZ (piezo Z avec un range de 300um), multi-canaux, multi-position, mosaïque, multi-puits, timelapse
    maintien de focus, acquisition en 2 couleur simultanée grâce aux 2 caméras


    Sources d'illumination:
    1 banc laser pour le mode confocal:
    405nm (100mW), 488nm (150mW), 561nm (100mW) et 637nm (140mW)

    Configuration spectrale:
    2 dichroïques dans la tête: soit 100% vers camera droite soit dichroique 565 pour DAPI/GFP camera verticale et mCherry/Cy5 camera droite
    6 filtres d'émission dans roue externe:
    DAPI (450/50), GFP (525/50), mCherry (620/60), Cy5 (700/775), GFP/mCherry D
    Supports d'échantillons compatibles:
    boîtes de 35mm à fond lamelle de verre #1.5, lame en verre avec lamelle de verre #1.5 ou plaque multi-puits à fond lamelle de verre
    

    Publié dans Imagerie automatisée

    Spinning disk Nikon Ti Inscoper CSU-X1

    
    Tarif établissement partenaire: 15.66 €/heure
    Tarif établissement public et privé : 55.41 €/heure
    Technologies associées :
  • Imagerie 3D
  • Vidéomicroscopie

    • Brève description :
    Microscope Nikon inversé couplé à une tête spinning Yokogawa CSU-X1 dédié à l'imagerie confocale 3D d'échantillons vivants. Toutes les périphériques sont contrôlés par la boitier électronique Inscoper pour optimiser la gestion et accélérer les acquisitions

    Piloté par le logiciel Inscoper
    Objectifs:
    10X Plan 0.25 NA air
    20X Plan Apo lambda 0.75 NA air
    40X Plan Fluor 1.3 NA huile
    60X Plan Apo lambda 1.4 NA huile
    100X Plan Apo lambda 1.45 NA huile

    Détecteur:
    1 caméra sCMOS back-illuminated Prime95B Photometrics
    (1200*1200, 11µm taille de pixel)

    Contrôle environnemental: température et CO2
    Type d'acquisition:
    acquisition multi-dimensionnelle en lumière transmise, DIC et confocale en fluorescence: XYZ, multi-canaux, multi-position, mosaïque, multi-puits, timelapse
    maintien de focus
    protocole personnalisable grâce au logiciel Inscoper
    Sources d'illumination:
    1 banc laser Oxxius:
    405nm (50mW), 488nm (100mW), 561nm (100mW) et 638nm (100mW)

    Configuration spectrale:
    3 dichroïques dans la tête: MONO (488), DUAL (488-561) et QUAD (405-488-561-640)
    6 filtres d'émission dans roue externe:
    DAPI (447/60), GFP (525/30), RFP (607/36), Cy5 (685/40), GFP/Cherry (512-23/630-90), DAPI/GFP/Cherry/Cy5 (440-40/521-21/607-34/700-45)
    Supports d'échantillons compatibles:
    boîtes de 35mm à fond lamelle de verre #1.5, lame en verre avec lamelle de verre #1.5 ou plaque multi-puits à fond lamelle de verre
    

    Publié dans Microscopie confocale

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