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Opera Phenix


Tarif établissement partenaire: 37.04 €/heure
Tarif établissement public et privé : 101.89 €/heure
Technologies associées :
  • High Content Screening
  • Analyse d'images

  • Brève description :
    Microscope inversé automatisé à épifluorescence, champ plein et confocal (spinning disk) à 2 caméras. Idéal pour la mesure et l'analyse du contenu cellulaire à haut débit d'un grand nombre d’échantillons (cellules, sphéroïdes...) fixés ou vivants et en micro-plaque
    Piloté par le logiciel Harmony
    Objectifs Zeiss:
    5X air 0.16NA Plan Apochromat
    10X air 0.3NA EC Plan Neofluar
    20X air O.4NA LD Plan Neofluar
    20X air O.8NA Plan Apochromat
    63X eau 1.15NA LD C-Apochromat

    Bras robotique Twister III pour charger les plaques
    Source d'excitation:
    4 Lasers : 405 nm, 488 nm, 561 nm et 640 nm

    Filtres d'émissions:
    435-550 nm, -435-480 nm, 500-550 nm, 570-630 nm et 650-760 nm

    Acquisition sur plaque multi-puits tout format (6 à 1536 puits)
    Détecteur:
    2 caméras sCMOS 4.7Mpx 16bits
    (2160 x 2160 pixels, 6,5µm taille du pixel)

    Contrôle environnemental: température et CO²
    Type d'applications:
    -acquisition d'images automatisée XYZ multi-canaux, multi-champs, multi-puits, multi-plaques, timelapse
    -analyse d'images à la volée: protocole d'analyse à personnaliser en Blocs (pipeline)
    -Preciscan XYZ : détection d'objets ou d’évènements rares à faible grossissement et ReScan automatisé à plus fort grossissement
    -Analyse et classification d'objet par Machine Learning
    

    Outils

    Pour les utilisateurs MRI ayant un identifiant et un mot de passe :

    •    Inscription à la plateforme MRI
    Pour utiliser les équipements de la plateforme, il faut d’abord pour vous inscrire et suivre les conditions d’entrée qui vous seront envoyées par mel.

    •    Perte du mot de passe
    En cas de perte de mot de passe, indiquez votre mel et vous pourrez changer votre mot de passe.

    •    Changer votre email dans votre compte MRI
    Connectez-vous et cliquez sur « manage my account »

    •    Système de réservation des équipements
    Gestion du planning des équipements. Pour réserver des équipements, il faut être inscrit à la plateforme MRI et avoir un identifiant et un mot de passe. Sans inscription, vous pouvez juste voir si l’équipement est disponible.


    •    GLPI MRI
    Ce logiciel permet de signaler des incidents sur les machines de la plateforme MRI (microscopes, cytométres, tomographe RX)

    •    Gestion des fichiers : serveur SFTP (voir guide d’installation)

    Cette interface vous permet de gérer vos fichiers, les transférer sur votre compte ou les télécharger. La sauvegarde de vos données est de 2 ans. L’effacement des données est automatique pour tous fichiers déposés il y a plus de 2 ans.

    •    OMERO
     Logiciel centralisé qui permet de gérer vos images, de les traiter, de les partager et de les stocker.

    •    GLPI pour MRI-NET
    Pour signaler des incidents, des anomalies ou des demandes en informatique.

    •    Redmine
    Ce logiciel permet de gérer les projets de la plateforme, certains projets sont publics et d’autres sont privés et non accessible pour les personnes non autorisées.

    En interne pour les responsables plateaux ::

    •    GLPI pour MRI-NET
    Ce logiciel permet de signaler des incidents ou des demandes en informatique.

    •    Dysfunction Editor

    Cette application permet de déclarer et gérer les dysfonctionnements sur les équipements en liaison avec le système de réservation.

    •    Autonomy Editor 

    Cette application permet de gérer les compétences des utilisateurs sur les équipements en liaison avec le système de réservation.

    •    Congés
    
Suivi des congés du personnel de la plateforme MRI.

    •    Qualité
    Système de gestion des documents pour la qualité

    •    Owncloud
    Gestion des documents et du calendrier en ligne pour le suivi qualité de la plateforme. Partage des documents qualité.

    •    Webmail
    
Notre système de gestion des mails pour le personnel ayant une adresse en « mri.cnrs.fr ».

    Préparation d'échantillons

     

    -Automates pour la Microscopie électronique à balayage :

    °Point Critique CO2 : CPD030 Baltec

    °Métalliseur ou Sputter Cutter : SC500-POLARON

    -Automates pour la Microscopie électronique à transmission

    °Inclusion en résine pour des études de morphologie : AMW Leica

    °Inclusion à froid pour immunomarquage et CLEM : AFS Leica

    °Contraste de grilles par coloration : AC20 Leica

    °Immunogold sur coupe : IGL Leica

    -Coupe ultrafines : ULTRA-MICROTOME

    °Reichert UltraCut S Leica 1

    °Reichert UltraCut S Leica 2

    Présentation

    Montpellier Ressources Imagerie est une Plate-Forme Technologique multi-sites de l’UAR Biocampus, labellisée IBiSA, certifiée ISO 9001-2015 NFX 50-900 et membre de l'infrastructure nationale France-BioImaging. La direction de MRI est assurée par Patrick Lemaire en tant que directeur scientifique et Virginie Georget en tant que responsable opérationnelle.

    MRI vous propose équipements et expertises en microscopie photonique, microscopie électronique, criblage, µtomographie à rayons X et cytométrie en flux, ainsi qu’en analyse d’images et développement de logiciels afin de vous accompagner dans vos projets scientifiques en biologie du vivant.

    La plate-forme est ouverte au secteur public et au secteur privé sans aucune condition thématique, institutionnelle ou géographique.

    Après inscription et formation par les ingénieurs MRI, les utilisateurs et utilisatrices peuvent réserver les équipements en ligne où qu'ils ou elles soient.

    En cas de publications de données acquises sur nos différents plateaux MRI, nous demandons à nos utilisateurs d'indiquer en remerciement la phrase suivante "We acknowledge the imaging facility MRI, member of the France-BioImaging national infrastructure supported by the French National Research Agency (ANR-10-INBS-04, «Investments for the future»)"

    Quand un ingénieur MRI est associé aux publications, nous demandons à ce que son affiliation soit :

    1) Montpellier Ressources Imagerie, BioCampus, University of Montpellier, CNRS, INSERM, Montpellier, France

    et s'il est affecté à une unité de recherche autre que BioCampus alors devra apparaître une deuxième affiliation :

    2) "acronyme de l'unité d'affectation", University of Montpellier, "les tutelles de l'unité", Montpellier, France.

     

    Nos tutelles scientifiques et partenaires institutionnels

     237px CNRS fr quadri.svg     logo generique SD     LOGO original RVB petit         Logotype INRAE transparent logo cirad transp     logo generique SD logoMSA2014 vert Web  OC 1706 instit logo rectangle quadri 150x150 72dpi     

    Nos unités d'appui

    CRBM   IGH   IGMM   INM   IGF   CBS   DBS-UM   IPSiM  AGAP   DIADE   ISEM   DMEM   LPHI  IRMB   IRCM

     

    Nos gages de Qualité

     Logo BioCampus web blanc         ISO 9001 and NFX 50 900         ibisa

    Notre périmètre actuel de certification ISO9001 et NFX50-900 concerne "la mise à disposition d'instruments, d'expertise et réalisation de prestations de services et de projets collaboratifs pour l'imagerie scientifique (microscopie optique, cytométrie en flux, criblage, tomographie RX"

    ORGANISATION CHART

    SCIENTIFIC POLICY

    BILLING AUTHORIZATION

    Présentation

    Nos services, offert à la communauté scientifique, sont proposés ou développés par le service informatique de la plateforme MRI, MRI-NET.

     PERSONNEL

     
    MRI-NET
    Responsable
     Stephane Laborie
    MRI-NET
    Gestionnaire de parc


    EXPLOITATION (MRI-NET)

    MRI-NET assure les missions d’exploitation et d’évolution de l’infrastructure informatique et de supports aux utilisateurs.

    Le rôle de MRI-NET est de suivre l’exploitation de ces postes, de les maintenir et de les intégrer dans les plateaux techniques en accord avec leurs règles de sécurité locale établies par les organismes de tutelles.

    MRI-NET assure les missions d’assistance aux utilisateurs et ingénieurs des plateaux.

    MRI-NET gére les inscriptions, les groupes de crédit, la mise en place de la tarification dans le système de comptage du «temps machine» et assiste les utilisateurs sur la gestion de leur compte.

    MRI-NET assure le développement et la mise en production des outils métiers de gestion de la plateforme.

     Où nous trouver ?

    CRBM UMR5237

    1919 route de Mende
    34293 Montpellier Cedex 05

    Téléphone MRI-NET : +33 4 34 35 96 73 / 96 60
    Téléphone gestion : +33 4 34 35 95 68
    Téléphone MRI-DEV : +33 4 34 35 95 18

    GPS : Latitude = 43.63767 ; Longitude = 3.86544